Network
Indonesains - Tim peneliti yang dipimpin ilmuwan Stockholm University mengekstrak dan mengurutkan RNA dari harimau Tasmania yang telah punah di dunia binatang. Mereka menganalisis sejarah RNA dari otot dan jaringan kulit harimau Tasmania (Thylacinus cynocephalus) berusia 130 tahun.
Jaringan kulit tersebut sebelumnya diawetkan dalam pengeringan pada suhu kamar di Museum Sejarah Alam Swedia. Studi ini dipublikasikan di jurnal Genome Research.
Hasil penelitian tersebut dipublikasikan dengan judul "Historical RNA expression profiles from the extinct Tasmanian tiger" yang dapat diakses secara daring.
Harimau Tasmania, juga dikenal sebagai harimau Tasmania atau serigala berkantung, adalah hewan berkantung karnivora dan predator puncak di Tasmania.
Spesies ini adalah salah satu dari sedikit hewan berkantung yang memiliki kantong pada kedua jenis kelamin.
Harimau Tasmania tampak seperti campuran beberapa hewan. Itu adalah ukuran dan bentuk anjing berukuran sedang hingga besar, tetapi memiliki garis-garis seperti harimau di punggung bawah dan kantong perut.
Catatan fosil menunjukkan bahwa harimau Tasmania muncul sekitar 4 juta tahun yang lalu di Australia. Pada abad ke-20, spesies ini sudah punah, atau sangat langka, di daratan utama namun masih ditemukan di Tasmania, negara kepulauan di lepas pantai selatan Australia.
Kematian harimau Tasmania dapat dikaitkan secara langsung dengan skema pemberian hadiah yang diberlakukan pada tahun 1830-1914 yang mengakibatkan terbunuhnya beberapa ribu hewan dan secara tidak langsung hilangnya habitatnya akibat aktivitas peternakan.
Harimau Tasmania terakhir diketahui mati pada tahun 1936, di Kebun Binatang Beaumaris di Hobart, Tasmania, dan hanya sedikit yang diketahui tentang perilaku alami spesies tersebut di dunia binatang.
Upaya baru-baru ini untuk memberantas kepunahan berfokus pada harimau Tasmania, karena sebagian besar habitat alaminya di Tasmania masih dilestarikan. Pelepasliaran kembali dapat membantu memulihkan keseimbangan ekosistem dunia binatang yang hilang setelah kepunahan terakhirnya.
Namun, merekonstruksi harimau Tasmania yang hidup dan fungsional tidak hanya memerlukan pengetahuan komprehensif tentang genomnya (DNA).
Namun juga dinamika ekspresi gen spesifik jaringan dan cara kerja regulasi gen, yang hanya dapat dicapai dengan mempelajari transkriptome (RNA).
“Menghidupkan kembali harimau Tasmania atau mamut berbulu bukanlah tugas yang mudah, dan memerlukan pengetahuan mendalam tentang regulasi genom dan transkriptom dari spesies terkenal tersebut, sesuatu yang baru sekarang mulai terungkap,” kata penulis utama Dr. Emilio Mármol, peneliti di University of Stockholm.
Dalam penelitian mereka, Dr. Mármol dan rekannya mengekstraksi dan mengurutkan transkriptom dari otot dan jaringan kulit spesimen harimau Tasmania kering berusia 130 tahun dari Museum Sejarah Alam Swedia.
Hal ini mengarah pada identifikasi tanda ekspresi gen spesifik jaringan yang mirip dengan mamalia berkantung dan berplasenta yang masih hidup.
Transkriptom yang dipulihkan memiliki kualitas yang sangat baik sehingga memungkinkan untuk mengidentifikasi RNA pengkode protein spesifik otot dan kulit, dan menyebabkan anotasi pada gen RNA ribosom dan mikroRNA yang hilang, yang kemudian mengikuti rekomendasi MirGeneDB.
“Ini adalah pertama kalinya kami melihat sekilas keberadaan gen pengatur khusus harimau Tasmania, seperti microRNA, yang punah lebih dari satu abad yang lalu,” kata Dr. Marc R. Friedländer dari Universitas Stockholm.
Studi dunia binatang ini membuka peluang dan implikasi baru yang menarik untuk mengeksplorasi koleksi besar spesimen dan jaringan yang disimpan di museum di seluruh dunia, tempat molekul RNA mungkin menunggu untuk ditemukan dan diurutkan.
“Di masa depan, kita mungkin dapat memulihkan RNA tidak hanya dari hewan yang punah, tetapi juga genom virus RNA seperti SARS-CoV2 dan prekursor evolusinya dari kulit kelelawar dan organisme inang lainnya yang disimpan di koleksi museum,” kata peneliti Profesor Love Dalén.***
