Network
Namun, merekonstruksi harimau Tasmania yang hidup dan fungsional tidak hanya memerlukan pengetahuan komprehensif tentang genomnya (DNA).
Namun juga dinamika ekspresi gen spesifik jaringan dan cara kerja regulasi gen, yang hanya dapat dicapai dengan mempelajari transkriptome (RNA).
“Menghidupkan kembali harimau Tasmania atau mamut berbulu bukanlah tugas yang mudah, dan memerlukan pengetahuan mendalam tentang regulasi genom dan transkriptom dari spesies terkenal tersebut, sesuatu yang baru sekarang mulai terungkap,” kata penulis utama Dr. Emilio Mármol, peneliti di University of Stockholm.
Dalam penelitian mereka, Dr. Mármol dan rekannya mengekstraksi dan mengurutkan transkriptom dari otot dan jaringan kulit spesimen harimau Tasmania kering berusia 130 tahun dari Museum Sejarah Alam Swedia.
Hal ini mengarah pada identifikasi tanda ekspresi gen spesifik jaringan yang mirip dengan mamalia berkantung dan berplasenta yang masih hidup.
Transkriptom yang dipulihkan memiliki kualitas yang sangat baik sehingga memungkinkan untuk mengidentifikasi RNA pengkode protein spesifik otot dan kulit, dan menyebabkan anotasi pada gen RNA ribosom dan mikroRNA yang hilang, yang kemudian mengikuti rekomendasi MirGeneDB.
“Ini adalah pertama kalinya kami melihat sekilas keberadaan gen pengatur khusus harimau Tasmania, seperti microRNA, yang punah lebih dari satu abad yang lalu,” kata Dr. Marc R. Friedländer dari Universitas Stockholm.
Studi dunia binatang ini membuka peluang dan implikasi baru yang menarik untuk mengeksplorasi koleksi besar spesimen dan jaringan yang disimpan di museum di seluruh dunia, tempat molekul RNA mungkin menunggu untuk ditemukan dan diurutkan.
“Di masa depan, kita mungkin dapat memulihkan RNA tidak hanya dari hewan yang punah, tetapi juga genom virus RNA seperti SARS-CoV2 dan prekursor evolusinya dari kulit kelelawar dan organisme inang lainnya yang disimpan di koleksi museum,” kata peneliti Profesor Love Dalén.***
